工业电子显微镜在光学设计上采用先进的HC无限远轴向、径向双重色差校正光学技术，*消除杂散光等干扰因素，可配多种观察筒，适应不同的要求与检测观察方式，操作简单，检测快捷高效。对涉及成像质量的所有组件(物镜、镜筒透镜、目镜筒、目镜、照相接口等)进行优化组合，实现图像分辨率和反差的优化，得到锐利图像的同时追求高分辨率。
理论上，任何光学系统都不能生成理想的像，因为客观条件下，各类像差的存在影响了工业电子显微镜的成像质量。除了像差之外，还有一些自身存在的因素影响成像质量，主要有如下几点：
1、在使用时，被检物体做的比较标准很重要。如：切片厚度是否太厚，盖玻片是否符合标准等。
2、视场光栏应根据观察不同的被检物体和物镜倍率开启到合适的位置，如开得过大或过小显微图像的视场亮度会受到影响。
3、物镜按档次可分为6～8个档，较常用的为平场消色差物镜。如镜头档次太低，则成像质量会下降。因此，建议选择平场以上档次物镜。
4、聚光镜孔径光栏尽量和物镜的数值孔径相符，才能得到较好的图像分辨率。
5、载物台在观察切片时，常做X、Y轴的移动。如：双层机械移动台，精度和稳定性较好，能在观察显微图像时提供好的成像质量。
6、非球面聚光镜能提供非常均匀的照明光线，所观察到的显微图像衬度较佳。
7、调焦系统作为机械部分的重要部件，调焦精度也非常重要。对于生物学初学者或刚接触该设备的操作者，熟练使用调调焦系统，能快速找到图像并聚焦，提高工作效率。
8、照明系统如采用温度低，色温较高的照明装置，观察到的是分辨率和锐利度较高的显微图像。
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